edit
ローマ字入力でMicrosoft IMEに慣れている方は「ゃ」の文字があるcyaやkyaなどの入力ができない時場合はありませんか?
SCIM-Anthyであれば、ローマ字入力形式を変更することにより、慣れたローマ字入力形式に変更することができます。
SCIM入力メソッドの設定を以下の手順で表示します。
尚、ローマ字テーブルには以下のものがありました。 慣れているローマ字テーブルに変更すれば入力効率が向上しますね。
Ubuntu/iBusからSCIM-Anthyに変更する